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關(guān)于我們

嘉安健達醫(yī)學(xué)科技(上海)有限公司是成立于上海的一家生物領(lǐng)域戰(zhàn)略性新型科技企業(yè),逐步組建高標準的二代測序中心、臨床檢測平臺,在此基礎(chǔ)上建立醫(yī)學(xué)科研、轉(zhuǎn)化與應(yīng)用平臺,致力于NGS技術(shù)、PCR技術(shù)等研發(fā)及臨床產(chǎn)業(yè)化。嘉安健達在生物醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、檢驗醫(yī)學(xué)、生物信息學(xué)算法開發(fā)等領(lǐng)域深耕多年,擁有強大的知識體系與實戰(zhàn)經(jīng)驗。

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2024-12-19 08:08:01

一代、二代、三代測序的區(qū)別分別是什么?

一代測序是上世紀70年代由Sanger和Coulson開創(chuàng)的DNA雙脫氧鏈終止法測序,也稱為Sanger測序。

二代測序技術(shù)(NGS)是為了改進一代測序通量過低的問題而出現(xiàn)的,能夠同時對上百萬甚至數(shù)十億個DNA分子進行測序?qū)崿F(xiàn)了大規(guī)模、高通量測序的目標。

三代測序主要有兩種技術(shù)PacBio公司的SMRT和Oxford Nanopore 的納米孔單分子測序技術(shù),這兩種技術(shù)的測序讀長都可以達到幾-kb的級別,遠遠高于二代測序技術(shù)。 16s測序是二代測序嗎?上海嘉安健達二代測序技術(shù)

二代測序——蛋白質(zhì)甲基化

概念及位置:蛋白質(zhì)甲基化是指在蛋白質(zhì)的氨基酸殘基上添加甲基基團。常見的甲基化修飾位點包括精氨酸(Arg)和賴氨酸(Lys)殘基。

作用

1、調(diào)節(jié)蛋白質(zhì) - 蛋白質(zhì)相互作用:例如,組蛋白(染色體的組成成分)的甲基化可以改變?nèi)旧|(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能,影響基因的可及性。當組蛋白 H3 的賴氨酸殘基(如 H3K4、H3K9 等)發(fā)生甲基化時,會招募不同的蛋白質(zhì)復(fù)合物,從而***或抑制基因轉(zhuǎn)錄。2、調(diào)節(jié)酶的活性:某些酶的活性可以通過蛋白質(zhì)甲基化來調(diào)節(jié)。甲基化可能改變酶的活性中心的結(jié)構(gòu)或者影響其與底物的結(jié)合能力。

檢測方法:質(zhì)譜分析:這是一種***用于檢測蛋白質(zhì)甲基化的方法。它能夠精確地確定蛋白質(zhì)分子的質(zhì)量,通過比較甲基化和未甲基化蛋白質(zhì)的質(zhì)譜圖,可以鑒定甲基化位點和修飾程度。 上海嘉安健達二代測序公司二代測序的過程有哪些?

二代測序—全外顯子測序的應(yīng)用領(lǐng)域

醫(yī)學(xué)領(lǐng)域:1、疾病診斷:用于診斷各種遺傳性疾病,包括單基因遺傳?。ㄈ缒倚岳w維化、杜氏肌營養(yǎng)不良等)和復(fù)雜疾病(如**、心血管疾病等)。在**研究中,通過對**組織和正常組織進行全外顯子測序,可以發(fā)現(xiàn)腫瘤細胞中的體細胞突變,這些突變可能是導(dǎo)致**發(fā)生、發(fā)展的關(guān)鍵因素,有助于醫(yī)生制定個性化的**方案。2、藥物研發(fā):幫助研究人員了解藥物靶點的基因變異情況。例如,如果發(fā)現(xiàn)某些患者的藥物靶點基因外顯子區(qū)域存在突變,可能會影響藥物的療效,從而可以針對性地開發(fā)新的藥物或者調(diào)整藥物的使用劑量和方式。

遺傳學(xué)研究:用于研究人類群體的遺傳多樣性,通過對不同人群的外顯子測序,可以發(fā)現(xiàn)不同人群之間的基因差異,這些差異可能與人群的適應(yīng)性、易感性等有關(guān)。還可以用于追蹤基因的進化歷程,了解基因在進化過程中的變化情況。

二代測序—全外顯子測序的局限性

不能檢測所有的遺傳變異:它只能檢測外顯子區(qū)域的變異,對于非外顯子區(qū)域(如內(nèi)含子、基因間區(qū)域)的變異無法檢測,而這些區(qū)域的某些變異也可能對基因的表達和功能產(chǎn)生重要影響,如內(nèi)含子中的突變可能影響基因的剪接。

數(shù)據(jù)分析復(fù)雜:全外顯子測序會產(chǎn)生大量的數(shù)據(jù),需要復(fù)雜的生物信息學(xué)工具和方法來進行數(shù)據(jù)分析。包括數(shù)據(jù)的質(zhì)量控制、變異的檢測和注釋、致病性的評估等多個環(huán)節(jié),其中任何一個環(huán)節(jié)出現(xiàn)問題都可能導(dǎo)致錯誤的結(jié)論。 二代測序的優(yōu)勢是高準確性。

二代測序——基因組測序該測幾個G?

1、人類全基因組測序

常規(guī)全基因組測序:一般建議測序深度為30X-50X,人類基因組大小約為3G,因此數(shù)據(jù)量通常在90G-150G左右。這樣的測序深度可以較為***地檢測到基因組中的各種變異,包括單核苷酸多態(tài)性(SNP)、插入缺失(Indel)、結(jié)構(gòu)變異(SV)等,適用于大多數(shù)疾病研究、群體遺傳學(xué)研究以及個體遺傳特征分析等。

高深度全基因組測序:對于一些特殊的研究目的,如檢測低頻變異、體細胞突變等,可能需要更高的測序深度,達到100X甚至更高。此時數(shù)據(jù)量會相應(yīng)增加到300G及以上,這種高深度測序能夠更靈敏地發(fā)現(xiàn)罕見的遺傳變異,但成本也會大幅提高。 一代、二代、三代測序的區(qū)別是什么?上海嘉安健達二代測序技術(shù)

二代測序讀長方面比一代測序短很多。上海嘉安健達二代測序技術(shù)

①二代測序一般多久出結(jié)果?

二代測序(Next-GenerationSequencing,NGS)出結(jié)果的時間會受到多種因素的影響,一般在數(shù)天到數(shù)周不等。

1、樣本類型和質(zhì)量

不同的樣本類型處理時間不同。例如,血液樣本相對容易處理,提取DNA的過程比較常規(guī)。如果是組織樣本,可能需要先進行樣本的解離等復(fù)雜操作。如果樣本質(zhì)量高,DNA提取和文庫構(gòu)建等前期工作會比較順利,能加快整體進程。但如果樣本量少或者DNA有降解等質(zhì)量問題,可能需要重新提取樣本或者進行DNA修復(fù)等操作,這會**延長時間。例如,對于新鮮血液樣本,DNA提取可能在1-2天內(nèi)完成;而對于一些福爾馬林固定石蠟包埋(FFPE)組織樣本,可能需要3-5天來完成高質(zhì)量DNA的提取和后續(xù)的優(yōu)化處理。


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